Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOCADQ5VW36 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FOCADQ5VW36 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOCADQ5VW36 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms