Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFMBT2Q5VUG0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFMBT2Q5VUG0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms