Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
WDR78Q5VTH9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR78Q5VTH9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms