Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRIP1Q5VSL9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.57■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.56■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STRIP1Q5VSL9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRIP1Q5VSL9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms