Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIN9Q5TKA1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIN9Q5TKA1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms