Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD5Q5TGI4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD5Q5TGI4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms