Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
L1TD1Q5T7N2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
L1TD1Q5T7N2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
L1TD1Q5T7N2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms