Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC183Q5T5S1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms