Protein–RNA interactions for Protein: Q5R3I4

TTC38, Tetratricopeptide repeat protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC38Q5R3I4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC38Q5R3I4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC38Q5R3I4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC38Q5R3I4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC38Q5R3I4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC38Q5R3I4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC38Q5R3I4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC38Q5R3I4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC38Q5R3I4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC38Q5R3I4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC38Q5R3I4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC38Q5R3I4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC38Q5R3I4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC38Q5R3I4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC38Q5R3I4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC38Q5R3I4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC38Q5R3I4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC38Q5R3I4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
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