Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNT1Q5JUK3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms