Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMPK2Q5EBM0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMPK2Q5EBM0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms