Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFTN2Q52LD8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFTN2Q52LD8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFTN2Q52LD8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms