Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM259Q4ZIN3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM259Q4ZIN3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM259Q4ZIN3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms