Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXF1

FAM74A3, Putative protein FAM74A3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A3Q4VXF1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM74A3Q4VXF1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM74A3Q4VXF1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM74A3Q4VXF1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM74A3Q4VXF1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM74A3Q4VXF1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM74A3Q4VXF1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM74A3Q4VXF1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM74A3Q4VXF1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM74A3Q4VXF1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM74A3Q4VXF1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM74A3Q4VXF1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM74A3Q4VXF1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM74A3Q4VXF1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM74A3Q4VXF1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM74A3Q4VXF1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM74A3Q4VXF1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM74A3Q4VXF1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM74A3Q4VXF1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A3Q4VXF1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A3Q4VXF1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A3Q4VXF1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM74A3Q4VXF1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms