Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KHDC1Q4VXA5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KHDC1Q4VXA5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KHDC1Q4VXA5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms