Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TPRNQ4KMQ1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TPRNQ4KMQ1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPRNQ4KMQ1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
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