Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRY2Q49AN0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CRY2Q49AN0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRY2Q49AN0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms