Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTLL9Q3SXZ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms