Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP24-1Q3LI83 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP24-1Q3LI83 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms