Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VMACQ2NL98 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VMACQ2NL98 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VMACQ2NL98 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VMACQ2NL98 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VMACQ2NL98 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
VMACQ2NL98 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VMACQ2NL98 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VMACQ2NL98 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VMACQ2NL98 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VMACQ2NL98 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VMACQ2NL98 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VMACQ2NL98 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VMACQ2NL98 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VMACQ2NL98 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VMACQ2NL98 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VMACQ2NL98 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VMACQ2NL98 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VMACQ2NL98 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VMACQ2NL98 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VMACQ2NL98 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VMACQ2NL98 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VMACQ2NL98 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VMACQ2NL98 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VMACQ2NL98 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VMACQ2NL98 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VMACQ2NL98 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VMACQ2NL98 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VMACQ2NL98 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VMACQ2NL98 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VMACQ2NL98 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VMACQ2NL98 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VMACQ2NL98 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VMACQ2NL98 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VMACQ2NL98 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VMACQ2NL98 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VMACQ2NL98 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VMACQ2NL98 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VMACQ2NL98 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VMACQ2NL98 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VMACQ2NL98 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VMACQ2NL98 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VMACQ2NL98 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VMACQ2NL98 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VMACQ2NL98 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VMACQ2NL98 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VMACQ2NL98 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VMACQ2NL98 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VMACQ2NL98 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VMACQ2NL98 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VMACQ2NL98 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VMACQ2NL98 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VMACQ2NL98 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VMACQ2NL98 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VMACQ2NL98 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VMACQ2NL98 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VMACQ2NL98 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VMACQ2NL98 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VMACQ2NL98 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
VMACQ2NL98 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VMACQ2NL98 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VMACQ2NL98 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms