Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK4Q16654 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK4Q16654 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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