Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ECM1Q16610 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ECM1Q16610 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ECM1Q16610 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
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