Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC2Q16515 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC2Q16515 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ASIC2Q16515 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASIC2Q16515 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms