Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSX1Q16384 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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