Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMA4Q16363 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
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