Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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