Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMGN3Q15651 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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HMGN3Q15651 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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