Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF1Q15637 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF1Q15637 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SF1Q15637 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF1Q15637 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF1Q15637 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF1Q15637 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF1Q15637 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF1Q15637 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF1Q15637 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SF1Q15637 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF1Q15637 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF1Q15637 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF1Q15637 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF1Q15637 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF1Q15637 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF1Q15637 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SF1Q15637 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SF1Q15637 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SF1Q15637 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF1Q15637 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF1Q15637 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SF1Q15637 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF1Q15637 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF1Q15637 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF1Q15637 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SF1Q15637 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF1Q15637 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF1Q15637 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF1Q15637 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF1Q15637 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF1Q15637 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF1Q15637 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF1Q15637 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF1Q15637 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF1Q15637 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF1Q15637 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF1Q15637 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF1Q15637 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF1Q15637 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF1Q15637 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF1Q15637 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF1Q15637 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF1Q15637 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF1Q15637 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF1Q15637 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF1Q15637 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF1Q15637 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF1Q15637 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF1Q15637 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF1Q15637 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF1Q15637 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF1Q15637 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF1Q15637 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF1Q15637 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF1Q15637 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF1Q15637 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF1Q15637 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF1Q15637 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF1Q15637 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF1Q15637 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF1Q15637 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF1Q15637 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF1Q15637 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF1Q15637 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF1Q15637 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF1Q15637 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF1Q15637 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF1Q15637 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF1Q15637 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF1Q15637 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF1Q15637 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF1Q15637 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF1Q15637 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF1Q15637 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF1Q15637 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF1Q15637 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF1Q15637 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF1Q15637 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF1Q15637 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF1Q15637 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF1Q15637 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF1Q15637 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF1Q15637 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF1Q15637 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF1Q15637 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SF1Q15637 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SF1Q15637 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SF1Q15637 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SF1Q15637 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF1Q15637 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SF1Q15637 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SF1Q15637 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SF1Q15637 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SF1Q15637 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SF1Q15637 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF1Q15637 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF1Q15637 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF1Q15637 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF1Q15637 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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