Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRADDQ15628 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRADDQ15628 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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