Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEC23BQ15437 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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SEC23BQ15437 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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SEC23BQ15437 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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SEC23BQ15437 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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SEC23BQ15437 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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SEC23BQ15437 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC23BQ15437 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC23BQ15437 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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