Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR1Q15399 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR1Q15399 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms