Protein–RNA interactions for Protein: Q15287

RNPS1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1Q15287 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNPS1Q15287 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNPS1Q15287 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNPS1Q15287 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNPS1Q15287 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNPS1Q15287 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNPS1Q15287 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNPS1Q15287 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNPS1Q15287 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNPS1Q15287 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNPS1Q15287 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNPS1Q15287 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNPS1Q15287 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNPS1Q15287 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNPS1Q15287 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNPS1Q15287 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNPS1Q15287 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNPS1Q15287 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNPS1Q15287 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNPS1Q15287 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNPS1Q15287 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNPS1Q15287 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNPS1Q15287 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNPS1Q15287 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNPS1Q15287 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNPS1Q15287 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RNPS1Q15287 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RNPS1Q15287 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RNPS1Q15287 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNPS1Q15287 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNPS1Q15287 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNPS1Q15287 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNPS1Q15287 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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