Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PTPRKQ15262 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms