Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDK1Q15118 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDK1Q15118 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 787.4 ms