Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KARSQ15046 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KARSQ15046 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KARSQ15046 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KARSQ15046 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KARSQ15046 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KARSQ15046 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KARSQ15046 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KARSQ15046 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KARSQ15046 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KARSQ15046 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KARSQ15046 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KARSQ15046 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KARSQ15046 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KARSQ15046 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KARSQ15046 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KARSQ15046 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KARSQ15046 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KARSQ15046 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KARSQ15046 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KARSQ15046 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KARSQ15046 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KARSQ15046 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KARSQ15046 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KARSQ15046 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KARSQ15046 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KARSQ15046 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KARSQ15046 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KARSQ15046 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KARSQ15046 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KARSQ15046 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KARSQ15046 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KARSQ15046 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KARSQ15046 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KARSQ15046 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KARSQ15046 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KARSQ15046 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KARSQ15046 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KARSQ15046 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KARSQ15046 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KARSQ15046 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KARSQ15046 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KARSQ15046 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KARSQ15046 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KARSQ15046 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KARSQ15046 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KARSQ15046 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KARSQ15046 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KARSQ15046 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KARSQ15046 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KARSQ15046 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KARSQ15046 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KARSQ15046 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KARSQ15046 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KARSQ15046 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KARSQ15046 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KARSQ15046 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KARSQ15046 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KARSQ15046 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KARSQ15046 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KARSQ15046 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KARSQ15046 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KARSQ15046 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KARSQ15046 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KARSQ15046 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KARSQ15046 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KARSQ15046 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KARSQ15046 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KARSQ15046 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KARSQ15046 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KARSQ15046 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KARSQ15046 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KARSQ15046 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KARSQ15046 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KARSQ15046 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KARSQ15046 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KARSQ15046 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KARSQ15046 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KARSQ15046 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KARSQ15046 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KARSQ15046 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KARSQ15046 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KARSQ15046 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KARSQ15046 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KARSQ15046 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KARSQ15046 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KARSQ15046 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KARSQ15046 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KARSQ15046 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KARSQ15046 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KARSQ15046 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KARSQ15046 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KARSQ15046 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KARSQ15046 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KARSQ15046 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KARSQ15046 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KARSQ15046 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KARSQ15046 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KARSQ15046 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KARSQ15046 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
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