Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPHQ15003 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCAPHQ15003 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
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