Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBR1Q14596 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms