Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BECN1Q14457 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BECN1Q14457 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BECN1Q14457 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms