Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE1CQ14123 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE1CQ14123 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE1CQ14123 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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