Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CIRBPQ14011 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIRBPQ14011 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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