Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR4Q13639 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR4Q13639 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
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