Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRSQ13332 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRSQ13332 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRSQ13332 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
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