Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLN3Q13286 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN3Q13286 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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