Protein–RNA interactions for Protein: Q12999

TSPAN31, Tetraspanin-31, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31Q12999 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TSPAN31Q12999 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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TSPAN31Q12999 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TSPAN31Q12999 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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