Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFX1Q12986 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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