Protein–RNA interactions for Protein: Q12912

LRMP, Lymphoid-restricted membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMPQ12912 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRMPQ12912 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms