Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCRN3Q0VDG4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCRN3Q0VDG4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms