Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IFFO1Q0D2I5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms