Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF543Q08ER8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF543Q08ER8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms