Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
CAMSAP2Q08AD1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CAMSAP2Q08AD1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CAMSAP2Q08AD1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CAMSAP2Q08AD1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CAMSAP2Q08AD1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CAMSAP2Q08AD1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CAMSAP2Q08AD1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms